В первые дни Великой отечественной войны был призван на фронт вместе с двумя братьями Александром и Николаем, о чем свидетельствует Книга памяти Псковской области Куньинского района: «В первый день мобилизации на защиту Родины ушло только из деревни Харитоново около 40 колхозников: … три брата Жебраковых и многие другие.». С июня 1941 г. по август 1941 г. Иван Ефанович старшина роты 2885 стрелкового полка Южного фронта. С августа 1941 г. по апрель 1942 г. тяжело раненный на Западном фронте Иван Ефанович находился в эвакуационном госпитале № 2227 в г. Рязань. С апреля 1942 г. по июль 1942 г. Иван Ефанович командир взвода 126 стрелкового полка 41 гвардии стрелковой дивизии на Донском фронте. В 1942 г. Иван Ефанович получил тяжелое ранение на Брянском фронте и с июля 1942 г. по декабрь 1942 г. находился на лечении в эвакуационном госпитале № 3014 в г. Рязань. С декабря 1942 г. по июнь 1943 г. Иван Ефанович служил помощником командира взвода 161 армии запасного стрелкового полка Центрального фронта. С июня 1943 г. и на момент вступления в партию (март 1944 г.) он старший сержант 34 гвардейского артиллерийского полка 6 гвардии стрелковой Ровенской дивизии Центрального 1-ого Украинского фронта. Приказом Президиума Верховного Совета СССР от 24 марта 1944 г. № 5/н. 34 гвардейский артиллерийский полк 6 гвардейской стрелковой Ровенской Краснознаменной Дивизии, 13 Армии, 1-го Украинского фронта наводчик орудия 5-й батареи гвардии старший сержант Жебраков Иван Ефанович награжден медалью «За отвагу» за то, что он в боях 16 марта 1944 г. при прорыве обороны противника точно и быстро наводил свое орудие в цель. Находясь на прямой наводке под сильным артиллерийским минометным огнем противника, в результате точной наводки уничтожил три станковых пулемета и до 18 солдат и офицеров противника. Приказом Президиума Верховного Совета СССР от 16 августа 1944 г. № 44/н за образцовое выполнение боевых заданий командования на фронте борьбы с немецкими захватчиками и проявленные при этом доблесть и мужество, награжден Орденом «Красная Звезда»: «Товарищ Жебраков в бою смел и решителен. В боях при форсировании реки Висла с 3 по 6 августа 1944 г. под сильным артиллерийским и пулеметным обстрелом противника находился у орудия, и его быстрая работа заряжающего способствовала бесперебойному ведению артиллерийского огня по противнику. Товарищ Жебраков по личной инициативе ходил в разведку и выяснил обстановку, дав ценные сведения и целеуказания командиру дивизиона. За инициативу и бесстрашие, проявленное в боях, достоин правительственной награды – ордена «Славы 3 степени»», но награжден Орденом «Красная Звезда».