Семён Васильевич Гайдуков родился в 1925 году в селе Мачеха Хопёрского округа Сталинградской губернии РСФСР СССР (ныне село Киквидзенского района Волгоградской области Российской Федерации) в семье крестьянина Василия Андреевича Гайдукова. Украинец. Закончил семь классов сельской школы.В ряды Рабоче-крестьянской Красной Армии С. В. Гайдуков был призван Мачешанским райвоенкоматом Сталинградской области 7 февраля 1943 года. В боях с немецко-фашистскими захватчиками рядовой Гайдуков с 7 марта 1943 года в должности стрелка 1-й пулемётной роты 349-го стрелкового полка 26-й стрелковой дивизии в составе 11-й и 34-й армий Северо-Западного фронта (с июля 1943 года 26-я стрелковая дивизия во фронтовом подчинении). Боевое крещение принял в боях под Старой Руссой. В августе 1943 года Семён Васильевич был ранен, но быстро вернулся в строй.В связи с расформированием Северо-Западного фронта в ноябре 1943 года 26-я стрелковая дивизия была передана в состав 1-й ударной армии 2-го Прибалтийского фронта. В феврале — начале марта 1944 года Семён Васильевич участвовал в Старорусско-Новоржевской наступательной операции фронта в рамках Ленинградско-Новгородской стратегической операции. В марте дивизия, в которой служил рядовой Гайдуков, была передана в состав 22-й армии и до лета 1944 года вела позиционные бои вдоль немецкой линии обороны «Пантера».В июне 1944 года 26-я стрелковая дивизия вернулась в 1-ю ударную армию. В её составе рядовой С. В. Гайдуков участвовал в Режицко Двинской, Мадонской и Рижской операциях. В ходе Рижской операции 26-я стрелковая дивизия была передана в состав 46-й армии и принимала участие в Мемельской операции 1-го Прибалтийского фронта. С октября 1944 года до середины января 1945 года Семён Васильевич участвовал в блокаде Курляндской группировки противника.13 января 1945 года началась Восточно-Прусская операция. Рядовой С. В. Гайдуков принимал участие в Инстербургско-Кёнигсбергской операции 3-го Белорусского фронта, затем в ликвидации Земландской группировки врага в составе 1-го Прибалтийского фронта, за отличие в которой был награждён медалью «За отвагу» и произведён в ефрейторы. 24 февраля 1945 года 1-й Прибалтийский фронт был преобразован в Земландскую оперативную группу войск и в этом качестве был включён в состав 3-го Белорусского фронта. В апреле 1945 года ефрейтор С. В. Гайдуков принимал участие в Кёнигсбергской операции. Особо отличился Семён Васильевич при штурме Кёнигсберга. 349-му стрелковому полку 6 апреля 1945 года предстояло штурмовать город с юга. При прорыве обороны противника юго-восточнее посёлка Медгетен ефрейтор С. В. Гайдуков со своим пулемётом взобрался на господствующую высоту 30,6 и открыл с неё шквальный огонь по немецким позициям, уничтожив более 60 немецких солдат и офицеров. При прорыве второй линии немецких траншей на южной окраине посёлка Медгетен Семён Васильевич уничтожил 8 вражеских солдат и ещё 6 взял в плен, после чего захватил штаб миномётной батареи, где были обнаружены ценные документы. В последующих боях за Кёнигсберг ефрейтор С. В. Гайдуков был тяжело ранен и эвакуирован в госпиталь. На фронт он уже не вернулся. Победу Семён Васильевич встретил в госпитале.19 апреля 1945 года указом Президиума Верховного Совета СССР ефрейтору Гайдукову Семёну Васильевичу было присвоено звание Героя Советского Союза.После выздоровления Семён Васильевич был демобилизован и вернулся в родные места. Жил в селе Иловля Волгоградской области, работал инспектором Госстраха РСФСР. 6 июня 1996 года он скончался. Похоронен в посёлке городского типа Иловля.